SRA Toolkit 을 이용한 SRA 파일 FASTQ 로 전환하기Bioinformatics2012. 6. 7. 08:56
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NCBI SRA 파일을 다운로드 후 분석을 위한 FASTQ 파일 포멧으로 변경시 SRA-Toolkit 을 이용하여 변경한다.
SRA 파일이 Single 일 경우 fastq-dump 명령어로 변환하면 되지만 Paired-end 경우 다음과 같은 옵션을 지정하여 변경한다.
명령어 예제).
fastq-dump --split-files <SRA path>반응형
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