BLAST Nr/Nt 데이터베이스에서 시퀀싱 서열로 변환 명령어Bioinformatics2016. 2. 17. 10:56
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BLAST NR 데이터베이스에서 FASTA 형태의 Sequences 데이터를 추출할때 다음과 같은 명령어를 이용한다.
명령어 예제).
blastdbcmd \
-db est \
-dbtype nr \
-entry_batch myContigList.txt \
-outfmt %f \
-out myHitContigs.fasta반응형
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