Bioinformatics Bowtie Alignment 분석 도구 설치 및 실행 방법 - Bowtie Aliner 레퍼런스 인덱스를 생성한다. 명령어 예제). ~/bowtie-0.12.8/bowtie-build -f ~/hg19/hg19.fa /$output_path/$output_name 생성된 레퍼런스 인덱스 파일과 리드들을 이용한 Paired-end Alignment 분석을 실행한다. 명령어 예제). ~/bowtie-0.12.8/bowtie \ -v 2 -a -m 100 -q -p 1 \ -S /hg19/hg19 -X 1000 \ -1 ~/R1_001.fastq \ -2 ~/R2_001.fastq > /$output_path/$output.sam 공유하기 게시글 관리 구독하기Ctrl+C&V 로 하는 프로그래밍 'Bioinformatics' 카테고리의 다른 글 MapSplice2 Alignment 분석 도구 설치 및 실행 방법 (0) 2017.01.06 BLAST Nr/Nt 데이터베이스에서 시퀀싱 서열로 변환 명령어 (0) 2016.02.17 Burrow-wheeler Transform (BWT) (0) 2012.08.01 Burrows-Wheeler Aligner(BWA) Alignment 분석 도구 설치 및 실행 방법 (0) 2012.07.28 SRA Toolkit 을 이용한 SRA 파일 FASTQ 로 전환하기 (0) 2012.06.07 Contents 당신이 좋아할만한 콘텐츠 BLAST Nr/Nt 데이터베이스에서 시퀀싱 서열로 변환 명령어 2016.02.17 Burrow-wheeler Transform (BWT) 2012.08.01 Burrows-Wheeler Aligner(BWA) Alignment 분석 도구 설치 및 실행 방법 2012.07.28 SRA Toolkit 을 이용한 SRA 파일 FASTQ 로 전환하기 2012.06.07 댓글 0 + 이전 댓글 더보기