SparkBLAST 는 Spark 2.0 에서 정상 실행되며, BLAST 버젼은 2.2.29 으로 실행 테스트하였다. SparkBLAST 소스 다운로드 $ git clone https://github.com/Ufscar-Fiocruz-Ifsul/spark-blast2.0.git 소스 패키징을 위하여 sbt 를 설치한다. 설치하는 운영환경은 centOS 7.3에서 아래와 같은 명령어로 설치 가능 curl https://bintray.com/sbt/rpm/rpm | sudo tee /etc/yum.repos.d/bintray-sbt-rpm.repo sudo yum install sbt /home/kogun82/spark-blast2.0 위치에서 아래의 명령어로 패키징 $ sbt package 패키징 이후 /..
[Ubuntu] echo "deb https://dl.bintray.com/sbt/debian /" | sudo tee -a /etc/apt/sources.list.d/sbt.list sudo apt-key adv --keyserver hkp://keyserver.ubuntu.com:80 --recv 2EE0EA64E40A89B84B2DF73499E82A75642AC823 sudo apt-get update sudo apt-get install sbt [CentOS] curl https://bintray.com/sbt/rpm/rpm | sudo tee /etc/yum.repos.d/bintray-sbt-rpm.repo sudo yum install sbt
1). pasta와 pastaspark 소스를 git으로 다운받는다. 명령어). git clone https://github.com/citiususc/pastaspark.git git clone https://github.com/smirarab/pasta.git 2). pasta 폴더에 있는 run_pasta_gui.py 파일을 pastaspark 폴더에 복사한다. 3). 다음의 명령어로 pastaspark를 설치한다. 명령어). python setup.py develop --user 4). 설치 후 사용자 계정에 .local 이라는 폴더가 생성되며, pastaspark에 필요한 라이브러리와 실행파일들이 생성된다. 5). 샘플 예제 파일 실행하기 명령어). spark-submit --master loca..
MySQL 5.7.6 and later: ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED BY 'MyNewPass'; MySQL 5.7.5 and earlier: SET PASSWORD FOR 'root'@'localhost' = PASSWORD('MyNewPass');
1). yum 명령어를 이용하여 python-pip, python-devel 패키지 설치 yum install python-pip python-devel 2). pip 명령어를 이용하여 glances 를 설치한다. pip install glances
1). 시스템 준비 명령어 [centos] yum install autoconf automake curl gcc git libmnl-devel libuuid-devel lm-sensors make MySQL-python nc pkgconfig python python-psycopg2 PyYAML zlib-devel [ubuntu] apt-get install zlib1g-dev uuid-dev libmnl-dev gcc make git autoconf autoconf-archive autogen automake pkg-config curl 2). 코드 다운로드 git clone https://github.com/firehol/netdata.git --depth=1 cd netdata 3). 설치 ./ne..
1). Java MySQL connector 를 다운받고 sole 웹 서버의 라이브러리 폴더에 복사한다. ~/solr-5.3.0/server/solr-webapp/webapp/WEB-INF/lib 2). 생성한 core 폴더 /conf/solrconfig.xml 파일에 아래의 내용을 추가한다. data-config.xml 3). 생성한 core 폴더 /conf/data-config.xml 파일을 생성하고 아래의 내용을 추가한다. 4). 생성한 core 폴더 /conf/ managed-schema 파일에 데이터베이스에서 가져오는 정보와 같도록 filed 를 설정한다. user_id 5). solr 데몬을 다시 재시작 한다. 명령어 예제 ./solr restart -s /home/kogun82/workspa..