Ctrl+C&V 로 하는 프로그래밍
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1. 다운로드 MongoDB에 대한 기본 정보는 홈페이지인, http://www.mongodb.org 에서 얻길 바라고, 관심이 있으면 아래와 같이 간단히 설치하고 테스트 할수 있다. http://www.mongodb.org/downloads 에서 가장 최신 버전을 다운 받는다. 나는 Windows32-bit 1.6.0 버전을 다운 받는다. Try MongoDB Atlas Products Try MongoDB Atlas products free. Developers can choose to use in the cloud or download locally. Either way, our software makes it easy to work with data. www.mongodb.com 2) 설치 다운 ..
Windows 환경에서 MongoDB 설치1. 다운로드 MongoDB에 대한 기본 정보는 홈페이지인, http://www.mongodb.org 에서 얻길 바라고, 관심이 있으면 아래와 같이 간단히 설치하고 테스트 할수 있다. http://www.mongodb.org/downloads 에서 가장 최신 버전을 다운 받는다. 나는 Windows32-bit 1.6.0 버전을 다운 받는다. Try MongoDB Atlas Products Try MongoDB Atlas products free. Developers can choose to use in the cloud or download locally. Either way, our software makes it easy to work with data. www.mongodb.com 2) 설치 다운 ..
2012.05.23 -
Bowtie Aliner 레퍼런스 인덱스를 생성한다. 명령어 예제). ~/bowtie-0.12.8/bowtie-build -f ~/hg19/hg19.fa /$output_path/$output_name 생성된 레퍼런스 인덱스 파일과 리드들을 이용한 Paired-end Alignment 분석을 실행한다. 명령어 예제). ~/bowtie-0.12.8/bowtie \ -v 2 -a -m 100 -q -p 1 \ -S /hg19/hg19 -X 1000 \ -1 ~/R1_001.fastq \ -2 ~/R2_001.fastq > /$output_path/$output.sam
Bowtie Alignment 분석 도구 설치 및 실행 방법Bowtie Aliner 레퍼런스 인덱스를 생성한다. 명령어 예제). ~/bowtie-0.12.8/bowtie-build -f ~/hg19/hg19.fa /$output_path/$output_name 생성된 레퍼런스 인덱스 파일과 리드들을 이용한 Paired-end Alignment 분석을 실행한다. 명령어 예제). ~/bowtie-0.12.8/bowtie \ -v 2 -a -m 100 -q -p 1 \ -S /hg19/hg19 -X 1000 \ -1 ~/R1_001.fastq \ -2 ~/R2_001.fastq > /$output_path/$output.sam
2011.03.14 -
JDK를 다운받은 경로에서 /usr/local/ 밑으로 옮긴다. sudo /home/test/jdk-6u16-linux-i586.bin /usr/local/ sudo chmod a+x /usr/local/jdk-6u16-linux-i586.bin sudo sh /usr/local/jdk-6u16-linux-i586.bin sudo update-alternatives --install "local/bin/java" "java" "/local/bin/jdk1.6.0_16/jre/bin/java" 1 java -version JAVA PATH 설정 ln -s /usr/local/jdk.1.6.0_06 /usr/local/jdk sudo gedit /etc/profile 하단부에 아래의 정보를 추가한다. PAT..
Ubuntu에서 Java 설치 및 Path 설정하기JDK를 다운받은 경로에서 /usr/local/ 밑으로 옮긴다. sudo /home/test/jdk-6u16-linux-i586.bin /usr/local/ sudo chmod a+x /usr/local/jdk-6u16-linux-i586.bin sudo sh /usr/local/jdk-6u16-linux-i586.bin sudo update-alternatives --install "local/bin/java" "java" "/local/bin/jdk1.6.0_16/jre/bin/java" 1 java -version JAVA PATH 설정 ln -s /usr/local/jdk.1.6.0_06 /usr/local/jdk sudo gedit /etc/profile 하단부에 아래의 정보를 추가한다. PAT..
2010.10.31 -
1. NFS 마운트가 되어야 할 폴더가 있는 서버에서의 설정 /etc/export 에 다음과 같은 라인을 추가 하여 준다. /home/estpass/project 210.95.179.0/255.255.255.0(rw,async,no_root_squash) NFS 공유 폴더 : 접근 할 수 있는 IP 정보 : 폴더에 관한 권한 nfs service restart 2. 공유 폴더를 지정 할 서버에서의 설정 mount -t nfs address:/home/estpass/project mount point
리눅스 NFS 설정 및 실행 명령어1. NFS 마운트가 되어야 할 폴더가 있는 서버에서의 설정 /etc/export 에 다음과 같은 라인을 추가 하여 준다. /home/estpass/project 210.95.179.0/255.255.255.0(rw,async,no_root_squash) NFS 공유 폴더 : 접근 할 수 있는 IP 정보 : 폴더에 관한 권한 nfs service restart 2. 공유 폴더를 지정 할 서버에서의 설정 mount -t nfs address:/home/estpass/project mount point
2010.08.13 -
자바에서 데이터 전송은 객체이건 클레스이건 결국 바이트 타입으로 전송하게 되어진다. 데이터 전송 시 재 변환 가능한 형태로 변형되어지고 다시 읽었을 때 객체의 자료구조를 그래도 보존하지 않으면 안된다.(Serialization) 5.0 이 후 부터는 Serialization 인터페이스를 구현한 클래스에서 static fianl long 타입의 serialVersionUID 상수를 선언 하라는 경고 문구를 이클립스의 warning 아이콘으로 확인 할 수 있다. 만일 serialVersionUID를 지정하지 않으면 실행시점에서 JVM이 디폴트 값을 산정하게 되며,그 알고리은 Java(TM) Object Serialization Specification 정의된 것을 따른다고 한다. 그러나 모든 serializ..
Java serialVersionUID 자동 생성 방법과 정리자바에서 데이터 전송은 객체이건 클레스이건 결국 바이트 타입으로 전송하게 되어진다. 데이터 전송 시 재 변환 가능한 형태로 변형되어지고 다시 읽었을 때 객체의 자료구조를 그래도 보존하지 않으면 안된다.(Serialization) 5.0 이 후 부터는 Serialization 인터페이스를 구현한 클래스에서 static fianl long 타입의 serialVersionUID 상수를 선언 하라는 경고 문구를 이클립스의 warning 아이콘으로 확인 할 수 있다. 만일 serialVersionUID를 지정하지 않으면 실행시점에서 JVM이 디폴트 값을 산정하게 되며,그 알고리은 Java(TM) Object Serialization Specification 정의된 것을 따른다고 한다. 그러나 모든 serializ..
2010.07.19 -
1. 자바파일 설치 ./jdk-1_5_0_09-linux-i586-rpm.bin 2. 설치된곳을 find 명령어로 찾는다 find / -name javac 3. 환경파일 설정 vi /etc/profile JAVA_HOME=/usr/java/jdk1.6.0_12 export JAVA_HOME PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH CLASSPATH=$CLASSPATH:$JAVA_HOME/lib 4. 변경된 환경변수 적용 source /etc/profile
리눅스에서 JAVA classpass와 path 설정하기1. 자바파일 설치 ./jdk-1_5_0_09-linux-i586-rpm.bin 2. 설치된곳을 find 명령어로 찾는다 find / -name javac 3. 환경파일 설정 vi /etc/profile JAVA_HOME=/usr/java/jdk1.6.0_12 export JAVA_HOME PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH CLASSPATH=$CLASSPATH:$JAVA_HOME/lib 4. 변경된 환경변수 적용 source /etc/profile
2010.07.14