BLAST Nr/Nt 데이터베이스에서 시퀀싱 서열로 변환 명령어

BLAST NR 데이터베이스에서 FASTA 형태의 Sequences 데이터를 추출할때 다음과 같은 명령어를 이용한다. 

명령어 예제).

blastdbcmd \
-db est \
-dbtype nr \
-entry_batch myContigList.txt \
-outfmt %f \
-out myHitContigs.fasta